眼科医学部派驻第六医学中心（原海军总医院）眼科始建于1954年，为博士研究生培养单位和博士后流动站。2000年被批准为海军眼科专科中心，2005被批准为全军视光学中心，2015年被评为国家临床重点专科。现有医生12人（高职7人）、返聘专家2人，护士15人、技师5人。1993年科室开展玻璃体切割术；1995年开展白内障超声乳化并人工晶状体植入术；1996年开展准分子激光屈光矫正术；2001年建立北京斜视弱视专家会诊中心；2008年在国内率先开展圆锥角膜的角膜胶原交联治疗。近年科室发表学术论文150余篇（SCI 11篇，Medline 6篇）；主编、参编专著13部。获教育部科技进步一等奖1项、军队优秀图书一等奖1项、军队科技进步二等奖4项、军队医疗成果二等奖5项、军队科技进步三等奖3项、军队医疗成果三等奖4项。