第一医学中心
由原解放军总医院的内科、外科临床部、医技部和门诊部组建。在消化内镜治疗、机器人微创技术、5G远程手术、慢性肾病治疗等方面具有领先优势。
第二医学中心
原为解放军总医院南楼临床部。在老年多器官功能衰竭系列研究、老年慢性阻塞性肺疾病呼吸衰竭的机械通气、高龄患者心血管急危重症诊疗等方面具有领先优势。
第三医学中心
原为武警总医院，前身是1937年4月创建于延安的中央军委警卫营卫生所，在灾害救援医学、眼眶病、眩晕病诊疗等方面具有领先优势，担任国际医疗救援任务。
第四医学中心
原为解放军总医院第304临床部，前身是1945年11月诞生于东北的第二十九后方医院，是全军站创伤外科救治中心，以创（烧）伤、急救和危重症救治三大方向为主要特色。
第五医学中心
由原解放军第三0二医院、第三0七医院合并组建，前身分别为1939年11月组建的延安中央医院和1957年8月创建的国家卫生部同位素医院，在病原体感染导致的传染病和继发病、疑难重症肝病、血液病、肿瘤诊治等方面具有领先优势。
第六医学中心
原为海军总医院，前身是海军北京医院，在海战伤救治、援潜救生、高压氧治疗、结节病和视光学疾病诊治等方面具有领先优势。
第七医学中心
原为陆军总医院，前身为1912年在天津创建的国民政府陆军军医学校附属医院，在外科诊治、微创治疗、新生儿救治等方面具有特色优势。
第八医学中心
原为解放军第三O九医院，前身为1933年10月创建的红四方面军第三分院，在结核病防治、器官移植、呼吸危重症救治等方面具有特色优势。
海南医院
原为解放军总医院分院，在海战伤救治、皮肤病诊疗、5G远程门诊等方面具有特色优势。
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