第三医学中心口腔科设有口腔综合治疗台49台，年门诊量8万人次以上，年急诊量3000次以上。科室为北京市和全国第一批住院医师规范化培训基地，被评为北京市十佳专科基地。科室现有高级职称专家9人，中级职称14人。科室分设牙体牙髓、牙槽外科、口腔修复、正畸、牙周和种植等专业，主治各种牙体牙髓疾病、牙周病、粘膜病、牙列缺损或缺失、口腔颌面部炎症、创伤和颞下颌关节疾病等，在颌面创伤、牙齿保存治疗、显微根管治疗、复杂牙拔除、复杂种植手术及修复等领域达到军内和国内先进水平。