儿科医学部派驻第一医学中心儿科成立于1953年，是解放军总医院建院后的第一批科室。现有高职专家10人，专业技术人员95人。在国内率先开展了雷帕霉素治疗结节性硬化症合并难治性癫痫、ACTH联合硫酸镁治疗婴儿痉挛症及孤独症患儿肠道微生态移植的新技术、自体造血干细胞移植治疗儿童血液系统肿瘤及神经母细胞瘤的综合治疗等新技术。在新生儿重度窒息及早产儿救治方面抢救成功率较高，尤其早产儿视网膜病变和坏死性小肠结肠炎发病率远远低于国内平均水平。获重庆科技成果一等奖1项、军队医疗成果二等奖2项、中华医学科技奖三等奖1项。