妇产科医学部派驻第六医学中心妇产科转隶于原海军总医院妇产科，成立于1954年，是全军计划生育与优生优育指导中心，北京市危重孕产妇转诊中心、辅助生殖中心、北京市产前诊断中心，北京市住院医师规范化培训基地。现有高职专家18人，专业技术人员157人，包括妇科、产科、生殖、计划生育及产前诊断5个亚专业。妇科自2000年开始开展宫腹腔镜手术，是北京市开展妇科微创手术最早的科室之一；产科承担北京石景山区危重孕产妇转诊工作，在危重孕产妇救治方面具有丰富的经验；生殖中心成立于2007年，经批准正式运行夫精人工授精、供精人工授精（AID）、体外受精胚胎移植及其衍生技术，目前是北京市3家开展第三代胚胎植入前遗传学诊断的生殖中心之一，形成了单囊胚移植、子宫内膜容受性调整及卵巢功能减退诊治等特色技术，年取卵周期数和临床妊娠率居北京地区前茅。自2012年开展全军不孕不育集中诊治项目以来，为2000多官兵的家庭圆满做出了贡献。产前诊断中心是北京市卫健委审批的九家产前诊断机构之一。承担国家、省部级和军内基金10余项，获国家及军队成果10余项。