儿科医学部门急诊位居八一儿童医院一层，有宽敞明亮的候诊大厅；有洁净统一的诊室；有甲级心电监护、除颤仪、洗胃机器、输液泵及气管插管各种规格抢救用品；有舒适的输液大厅和独立的雾化中心区。设有儿童呼吸和哮喘、儿童慢咳和反复呼吸道感染，儿童基础内科、儿童神经和发育，儿童血液和肿瘤，儿童肾病和免疫，儿童泌尿外科，儿童基础外科，儿童心脏外科，儿童骨科，儿童神经外科、儿童内科重症、儿童外科重症、新生儿内科、新生儿外科、儿童保健门诊，儿童遗传代谢等17个专科门诊。同时设有3个急诊，门急诊检测实施完备，与中心共享先进全套的各种实验室及影像检查中心、还拥有儿童专用的肺功能机，儿童专用移动心电图机、儿童专用理疗仪、儿童专用排痰仪、儿童专用骨密度测量仪、儿童康复设备及电子自动体重、身高测量机等，从不同角度来满足不同患儿诊治需求。门急诊出诊医生大多数都是副主任医师及以上专家，急救值班医生都是资深主治医师，门急诊每年都接待二、三、四军医大实习学生临床实践，及儿科规范化培训医生，是军队医学生及儿科规范化培训教学科室，同时还兼全科医师培训任务，儿科门急诊越来越发挥它不可缺少的儿童医院基础学科作用。每年大约接诊200000人次，诊治疑难重危患者大约50000余人次，承担着军队系统和地方0-18周岁儿童门诊及急诊的医疗任务，