骨科医学部骨肿瘤科是基于原解放军总医院骨科骨肿瘤专业组，是国内最早将骨肿瘤外科独立成科的单位之一，目前已经成为全国最大的骨肿瘤专科诊治中心之一。科室有知名专家1名，主任医师2名，副主任医师3名，教授、博士研究生导师2名，副教授、硕士研究生导师2名。年门诊量2万人次，年开展骨与软组织肿瘤手术约1500余例。20世纪60年代起在国内率先开展了脊柱、骨盆肿瘤的切除，积累了丰富的临床经验，并在国内率先建立异体骨库用于肿瘤切除后的骨骼重建，经过多年的努力将骨肉瘤的治疗方案与国际接轨，大大提升了国内骨肉瘤患者的5年生存率和保肢率。2005年始成立骨肿瘤亚专科，结合国内外研究进展，开发出了以治疗骨肉瘤为主的301特色的骨肿瘤综合治疗体系，将骨肉瘤患者的5年生存率提升至70%以上，骨与软组织肿瘤保肢治疗，脊柱、骨盆的切除重建达到国内先进水平。骨科医学部自2020年成立以来，骨肿瘤亚专科率先完成科室整合改革，再次扬帆起航，开启了总医院骨肿瘤外科的新篇章。