2020年6月29日，心血管病医学部于解放军总医院第六医学中心正式挂牌成立。现有高职专家102名，医护人员300余名。心血管病医学部设冠心病科、心律失常科、结构性心脏病科、高血压病科、心力衰竭科、肺血管与血栓性疾病科、心脏超声科、成人心脏外科、小儿心脏外科、大血管外科、麻醉与体外循环科、重症医学科等12个亚专科和1个研究所。

医学部先后被国家评定为国家临床重点专科军队建设项目单位、全军老年心血管重点实验室、全军心血管应激实验室、全军心血管内科专业委员会主委单位、心血管疾病微创技术研究北京市重点实验室，是博士、硕士学位授予单位和博士后流动站，是国家卫健委心脏介入培训基地、国家临床药理基地、国家卫健委心血管专科医师培训基地、中华护理学会、北京护理学会、全军重症专科护士及心血管专科护士培训基地、全国心电培训中心、全军重症监护示范培训基地和护理规范服务培训基地。