解放军总医院第六医学中心（原海军总医院）病理科成立于1954年，科室现有高职专家3名，专业技术人员16人。科室开展石蜡包埋HE染色、组织化学、免疫组化、细胞涂片、液基细胞学、细胞蜡块、显色原位杂交、荧光原位杂交、荧光定量PCR等技术，进行活体组织病理检查、术中快速冰冻病理诊断、脱落细胞学、化疗药物敏感性和肿瘤靶点检测、院外疑难病例会诊、多学科临床病理讨论等项目，为患者疾病的诊断治疗和预后判断提供重要依据。科室人员获解放军杰出专业技术人才奖 1人、二等功 1人、三等功4人，并多次被评为先进科室、医德医风先进单位、清正廉洁先进集体等荣誉称号。

近年来，各项病理检查量达41000余例，其中常规活检22000余例、术中冰冻3000余例、细胞学15000余例、分子靶点检测3000余例。在神经、消化、呼吸、耳鼻喉头颈、淋巴造血系统疾病和分子病理研究诊断达国内先进水平，在海战伤救治技术研究方面取得显著成绩、并荣获国家科技进步二等奖。在国内首次诊断报告了脑致死性巴拉姆西阿米巴感染、上皮样炎性肌纤维母细胞肉瘤、进行性多灶性白质脑病、间变型颗粒细胞型星形细胞瘤等罕见疑难病例。

科室分子病理荧光原位杂交、基因测序及荧光定量PCR等检测平台通过“军队医疗机构分子病理检测项目技术审核”认证，分子诊断和技术人员获得临检中心和质控中心培训合格证书，参加全国和北京市各项年度质评合格。目前开展病理诊断（涎腺恶性肿瘤、胶质瘤、淋巴瘤、软组织肉瘤、肾细胞癌、特殊感染等）和肿瘤靶向用药（肺癌、乳腺癌、胃癌、大肠癌、胃肠间质肿瘤等）等相关分子检测指标60余种, 已完成了16800次测试，检测种类和数量位于同类医院前列，为患者的诊断和靶向治疗提供了重要依据，使近40%患者获益。

科室为海军医科大学、安徽医科大学及军科院研究生培养单位，齐齐哈尔医学院临床医学病理学方向和山西医科大学汾阳医学院病理技术专业的实习单位。现有硕士研究生导师1人，近年来，共培养硕士、博士9人，带教实习进修生35名。承担科研课题13项，包括国家自然科学基金、全军重大科研项目、总后重点课题等项目，经费支持超过300万；共发表论文276 篇，SCI收录16 篇；获科技进步奖36项（国家二等奖1 项，军队一等奖2项、二等奖7项）。为促进院内外和国内外学术交流，科室每年定期组织举办神经系统、淋巴造血系统和耳鼻喉头颈疾病的学术会议和研讨会。2020年举办的神经系统疾病学术会议全国线上参会人数达4100人，多次应邀参加全国及北京市的学术演讲。