生物医学工程与转化医学重点实验室是我院与北京航空航天大学联合申报，于2016年获批的工业和信息化部重点实验室，主任何昆仑教授，常务副主任王卫东研究员，副主任樊瑜波教授。研究领域包含医疗器械研发与临床评价、生物技术与组织工程、生物信息与医学大数据技术、生物医药与精准医疗四个方向。近年，实验室承担自然科学基金重大、重点、杰青、仪器专项、863、973、科技支撑等项目200余项，科研经费超2.7亿元， 发表SCI论文300余篇，编写专著10余部，申请/授权发明专利80余项，获国家科技进步一等奖和国家发明二等奖各1项、省部级奖16项。